1949年，平津战役结束后，四野部队南下参加解放中南战役，下辖12个野战军，领导班子均有调整。38军换成梁兴初，39军刘震不动，40军韩先楚不动，41军吴克华不动，42军换成吴瑞林，43军换成李作鹏，44军换成方强，45军换成陈伯钧，46军詹才芳，47军换成曹里怀，48军贺晋年，49军钟伟。
也就是说12个军军长，换了6位，被换下的军长，实际上大多数都提拔为兵团领导，并没有离开野战部队，如李天佑为兵团副司令，邓华为15兵团司令，洪学智为15兵团副司令，黄永胜为13兵团副司令。只有万毅从42军调特种兵纵队担任司令员。
特种兵纵队是机械化部队，由坦克、装甲车、炮兵、战车等组成。统辖炮兵、工兵、装甲兵部队，
部队南下中南地区，这些机械化装备不太能使用上，因为南方水网发达，多山地，坦克、战车发挥作用有限。本来想在衡宝战役中投入使用，但敌人溃败如决堤之水，战斗中几乎没有用到多少重武器，特种兵部队没有参加上什么大的战斗。
说起纵队司令万毅，在东北战场担任过1纵司令、政委，5纵司令等职。
有人说他打仗有一套，是“不怕一万，就怕万一（毅）”，这句话有些耐人寻味。
万毅参加革命时间短，但自从加入革命阵营，就被重点培养，抵达东北后，担任7纵司令。后1纵等部成立，让他的担任司令员。1纵下辖1师、2师都是老牌部队，能征惯战，让他担任司令员从某种意义上来说，看中的并非作战能力，而是他是东北籍将领。
对此，他也是心里非常清楚的。
1纵1师、2师是东北头等主力师，多次受到总部嘉奖。3师战斗力弱，是他的7纵改编而来。他曾经多次指挥战斗，原本可以打成歼灭战，在用兵上打成了消耗战。
1947年5月，总部准备将他换下到后方，但他执意要留在前线，考虑到其他因素最终安排他担任政委，明确让他跟李天佑学习打仗，不用做政治工作。从这一点来说，缺乏作战经验。
1948年3年，担任8个月政委后，参加指挥三战四平、四战四平后，调任5纵担任司令员。5纵是3个独立师改编而来，在辽西会战中，表现的不算很好，被总部批评。
平津战役时，率先入关作战，在副军长吴瑞林的领导下，打丰台战役取得不错的战绩。
1949年，全军改编后，他就被调离野战军，到特种兵纵队工作，军长由吴瑞林担任。特种兵部队主要是配合野战军作战，哪里需要支援就到哪里。
因为南下作战各方原因，使得特种兵纵队没有得到锻炼，1950年一部调北大荒开垦，一部分组建炮兵司令部。
42军抵达中南，主要就是剿匪工作，虽然在国内战场上打得虽然不算出色，可是在抗美援朝上，打得非常好，得到极大历练。
