1971年9月，军委副主席叶剑英在这一特殊时期开始主席军委日常工作。10月3日，中共中央决定成立军委办公会议，由叶剑英主持。此后，叶剑英力挽狂澜，使得军队迅速稳定。
然而，1976年周总理逝世后，国内的形势突变，这时，重病的毛主席将三军指挥权交到了陈锡联手中。
很快，中共中央发出了一号文件：
“经毛主席提议，中央政治局一致通过，由华国锋同志任国务院代总理；在叶剑英同志生病期间，由陈锡联同志负责主持中央军委工作。”
中央一号文件下达后，叶剑英大多数时候会参加一些中央会议，至于军队的事情，基本上不再介入。
与此同时，军中关于“陈锡联夺权”的传言也开始甚嚣尘上，叶剑英元帅和陈锡联的关系也陷入了微妙的尴尬之中。
一次，叶剑英元帅提出想要搬去广州居住，陈锡联听说后，立即给叶帅打去了电话，由于太过着急，电话接通后，他便说道：“叶帅，你不能去广州。”
没头没脑的一句话让叶剑英有些生气，他在电话那头质问道：“你是担心我回到广州捣鬼吗？”
陈锡联十分错愕，在原地拿着电话愣怔了好一会儿。看到夫人进来，他才委屈地说道：“我不想让叶帅离开北京，是因为想在政治局里多留下一票。”
由于种种原因，两人之间的误会一直没有解除。
1976年毛主席逝世后，为了党和人民，叶帅作出了粉碎阴谋集团的重要决定。为此，他秘密询问了许多老同志的意见，并得到了他们的支持。
由于对陈锡联还有误会，叶帅并没有亲自找他谈话，只是在与李先念谈话时，写下了陈锡联的名字，又打了一个问号。
李先念看后随即明白叶帅的意思，他亲自为陈锡联作保，叶帅这才放下心来。
后来，在华国锋做部署安排时，陈锡联也多次出现在会议上，并在粉碎阴谋集团的过程中作出了重要贡献。
与此同时，在此期间，陈锡联就已经向华国锋提出请叶帅继续主持中央军委的工作。之后，陈锡联也因为被质疑“夺权”，不免让一些老同志对他有看法。但叶剑英元帅却在重掌军权后，丝毫没有为难过他。
邓小平复出后，还多次为陈锡联解围，“陈锡联不是造反的人。”
1980年1月，为响应中央号召，陈锡联主动辞去一切领导职务，退居二线。
1999年6月10日，陈锡联在北京病逝，终年85岁。中央军委对他的一生作出了高度评价：
“在长期革命战争中，他以共产党人特有的大智大勇，敢打善打硬仗、恶仗，常能出奇制胜，在关键时刻发挥了关键作用。”
