在《诛仙》中，魔教有着万毒门、长生堂、合欢派、鬼王宗四大门派。
早在八百年前之时，魔教第一派系并不是四大门派中的任意一个，而是炼血堂。不过，在正魔大战中，黑心老人被散仙枯心上人以天琊神剑重创而死，炼血堂主要首脑也是尽皆战死，炼血堂逐步衰落。万毒门、合欢派、长生堂也是在这时兴起，传承久远，根深蒂固。
鬼王宗却是新兴的一个门派，起自于三百年前。因上代老鬼王得到天书第二卷，才开创了鬼王宗，并与合欢派、长生堂、万毒门三大宗派共分魔教的天下。
到正式故事之时，魔教四大门派之主都是想要一现黑心老人的盛况，统一魔教。这四人中尤其是鬼王的城府最深，精于算计，先后覆灭了三大门派。
长生堂和万毒门的覆灭还好说，但合欢派的覆灭实在是有些莫名其妙。
率先长生堂的覆灭
在魔教四大门派中，长生堂是第一个覆灭的门派。
长生堂的覆灭，还要牵连到魔教四大门派围攻青云门。当时四大门派需要选一个主事人，万毒门门主毒神资格最老，但心计颇深，拒绝当主事人；鬼王资历最浅，又精于算计，只想拉别人当主事人；合欢派的三妙仙子为人低调，也是拒绝当主事人。最终，四大门派商议一番，三人推了较为自大的玉阳子当主事人。
这一次攻打青云门之战，让长生堂的声望达到最鼎盛最巅峰。此时的长生堂也有十数个高手，都是玉阳子数百年间培养的亲信好手，长生堂实力并不不弱于其他三大门派。
玉阳子始料不及的是，青云之战中道玄发动了诛仙剑阵。在这弑神诛仙的神剑之下，玉阳子被斩断了一只左手，让他的道行大减。
不止如此，身为主事人的玉阳子把门派中的好手都派到了第一线。在最初血拼青云门首座长老时，好手耗去一半，诛仙剑阵下又折损了其余的好手。这让长生堂实力大损，直接成了魔教四大门派垫底的存在。
魔教之间本就攻伐严重，长生堂实力衰弱后危机重重。玉阳子当机立断，将长生堂的总堂搬到了西方的死亡沼泽，远离其他三大派阀势力范围，才得以喘息。不过，长生堂搬到死泽后，三大门派不断吞并其他魔教小门派，势力越来越大，长生堂的危机更加严重。
当炼血堂也被鬼王宗吞并后，魔教只剩下了四大门派。实力最弱的长生堂终于也成了三大门派的首要目标，万毒门、鬼王宗、合欢派三大门派促成了一次联手，由三公子鬼厉、秦无炎、金瓶儿带人去死泽击杀了玉阳子，长生堂被覆灭。
长生堂的覆灭主要原因在于玉阳子，他太过骄傲自大，当了要命的主事人，折损了太多的人才。
万毒门的覆灭
在长生堂覆灭后，三大门派以鬼王宗、万毒门实力最强，合欢派稍次。
鬼王想要灭掉万毒门和合欢派，并不是一件容易的事。这时的一个格局就是三足鼎立，谁也不敢动手，三大派阀彼此牵制。
不料，此时却是出现了两大变数，让鬼王有机可乘。
第一个变数是毒神，毒神因年岁太大死了。鬼王最忌惮的就是毒神，有毒神在，他就不敢动灭掉万毒门。但是，毒神竟然悄无声息的死了，打破了平衡。而且万毒门因毒神之死发生了内斗，毒神的四大弟子为了门主之位大打出手，实力有所折损。
就算是这样，万毒门的底蕴也是很强大的，高手众多。鬼王宗想要扳倒万毒门，也会元气大伤，只会让合欢派坐收渔翁之利。
苍松道人投靠鬼王宗后，给鬼王出了一个计谋，就是利用第二个变数——兽妖。
南疆兽妖从十万大山一路杀到中原，数量不计其数，形成了一场滔天大祸。而苍松的计谋，就是要用兽妖去覆灭万毒门。
这个计谋还是很好施展的。苍松偷袭兽神麾下十三妖王之一的刍吾，将它一路引到了万毒门总堂毒蛇谷的方向，又被鬼王、鬼先生、鬼厉、幽姬击杀在毒蛇谷。兽妖的嗅觉最为灵敏，发现刍吾被杀后，向北方长驱直入的兽妖队伍，分出四成涌向了毒蛇谷。
虽然只有四成兽妖，但也是不可计数。这些兽妖如同潮水一般涌向毒蛇谷，万毒门中虽有百毒子、吸血老妖、端木老祖、毒门四老等一流好手，也是被兽妖吞没。最终，万毒门除了秦无炎不知所踪，全部人员覆灭。
这个计谋中鬼王宗无一折损，就轻易借兽妖之手灭了最强的万毒门，可谓极其狠辣。
合欢派的覆灭
长生堂和万毒门覆灭后，只剩下了鬼王宗，因为合欢派也覆灭在了毒蛇谷。
苍松为鬼王出的计谋只能灭万毒门，却不能灭合欢派。鬼先生在这个基础上再加了一步，也能借兽妖灭掉合欢派。
在万毒门和兽妖血拼之时，鬼王向三妙仙子发书，要她一起前去救援同门万毒门。鬼王还特地表明说兽妖猖獗，只有合三派之力一搏才有几分胜算。
然后，鬼王带着一半以上的普通弟子去毒蛇谷杀了个尸横遍野。这样的情况下，终于引来了三妙仙子，她想要趁着三方两败俱伤之时来赶尽杀绝。最终，三妙仙子在内的合欢派却是全军覆没在毒蛇谷，鬼王却是溜之大吉了。
这个计划看似合理，实际上合欢派的覆灭有些莫名其妙。
合欢派的门主是三妙仙子，也是修为数百年的人物。虽然对三妙仙子的描述较少，但她为人低调，而且活了数百年，也是个人精级别的。
此时的情况是什么呢？兽妖之祸传遍天下，是天下人皆知的千古大劫，是天下人最深的恐惧。
天音寺、焚香谷乃至青云门，对这一次大劫都没有胜算可言。三妙仙子但凡正常点都知道避祸，而不是想要趁火打劫。正如焚香谷云易岚所说的：以我一向对魔教的了解，他们看如今兽妖如此势大，不要说与兽妖为敌，就算是兽妖无意中伤了他们，只怕他们也宁可哑忍下来，甘愿退缩。
就算是三妙仙子想要趁火打劫，也必然会探听清楚情况。实际情况是什么呢？鬼王带了一班普通弟子，没有带一个成名的人物，自己还偷偷溜走了。三妙仙子这样的人物不可能发现不了丝毫端倪，而且她是来要坐收渔翁之利的，万毒门的人和鬼王宗的人都拼死了，她还带人与兽妖血拼个什么劲，直接退走就可以了，结果却把自己和所有人拼死了。
最后就是合欢派的佼佼者——妙公子金瓶儿。自死泽之后，金瓶儿就去了南疆，她是接触过兽妖的，甚至还见识过兽神的厉害。但是，金瓶儿竟然就像与合欢派毫无瓜葛一样，没有传递丝毫消息。
因此，合欢派的覆灭太不合理了。正常的情况应该是这样的，三妙仙子接到金瓶儿传递的消息，深知兽妖难以对抗，带领合欢派退回西北蛮荒圣殿。
到修订版中，鬼王以兽妖覆灭万毒门、合欢派的情节就没有了。三妙仙子确实曾收过金瓶儿传递的消息，在兽妖之乱时她也是带着合欢派退到了蛮荒圣殿。而且毒神也没死，也是带着万毒门回到了蛮荒圣殿。
这才是正常思路，魔教是没人愿意沾染兽妖之祸的，他们又有退路，根本不用搏一个胜算。而青云门作为正派之首，是不得不奋命与兽妖血战。
