1936年12月12日，西安事变中，蒋介石成为阶下囚。张学良和杨虎城通电全国，提出抗日救亡的八项主张，并调兵遣将，准备应付中央讨伐军的进攻。
然而就在这个关键时刻，冯钦哉作为杨虎城的老部下，却投敌叛变。
其实，冯钦哉叛变，主要的原因还是通过国民党四十六军军长樊松甫的拉拢。
12月13日，在西安事变发生的第二天，国民党樊军占领了潼关，他们在原地等待着进一步指示。
而在他们的对面就是冯钦哉，当时他们正要接手潼关，但已经被樊军拿到。正在这个时候，樊崧甫给冯钦哉打来了一个电话。两人曾经也很是熟悉参加过北伐，开始樊崧甫就以旧相识的身份和他寒暄。之后又想套话，询问如果张学良和杨虎城叛变，你是什么态度？
冯钦哉直言，如果杨虎城要他打西安，他是不会干的。樊崧甫知道了冯钦哉的态度，感觉到能拉拢他，一时劝说冯军静静地等待解决。双方也频繁地传递着消息，没想到面对樊崧甫的拉拢，冯钦哉竟然一口答应。
其实，也和樊崧甫拉拢人的手段有着很大的关系。私下里，他还关照着冯钦哉的买卖。
不久之后，他还派出孔祥熙来拉拢冯钦哉，对他备施恩惠。冯钦哉自然受宠若惊，也就站到了樊崧甫这边。两人在和战的问题上保持着一致的立场，不参加张杨两人的叛乱。而当时远在南京的何应钦，一再命令樊军向西安进攻，也是这个原因。
冯钦哉后来彻底叛变，和樊崧甫等人发表了联名通电，大骂张学良是千古罪人，之后把杨虎城派来的联络参谋杀害。彻底宣布自己脱离了杨虎城。这样的局面，对西安来说是一个打击。
对此，杨虎城也没有什么办法。
在这之后，不管何应钦怎么威胁樊崧甫，樊崧甫都不让步。他之所以敢大胆拉拢冯钦哉，一方面是有孔祥熙做靠山，另一方面还是气何应钦给他的管制太小。之后在樊崧甫的说服下，何应钦派冯钦哉为渭北剿匪司令，拨款10万元。将军诶是被释放之后，冯钦哉职务上升，几乎和樊崧甫平起平坐。
西安事变之后，冯钦哉在国民党内部青云直上，仕途顺利，抗战爆发后，先后担任军团长、司令员等等。不过，在抗日战争结束之后，他也曾多次受到蒋介石嫡系将领的排挤，决定在解放前退隐。
解放战争之后，他才终于看清楚了形势，拒绝跟蒋介石南下去台湾。对于这个选择，他的态度始终坚定，他知道共产党是不杀俘虏的。
后来他还积极促成了北平的和平解放。在和谈的关键时刻，傅作义决定找一位和共产党关系密切的人作为自己的代表，冯钦哉和邓宝珊关系不错，促成了这段关系。
很快，他们顺利达成了协议。
北平和平解放之后，毛主席也曾下令给他安排合适的工作。
对此，冯钦哉态度却很是让人奇怪，他拒绝道：“我不能对不起蒋介石，就算枪毙也不做官，我要学傅青主……”于是，他在家养鸡，过着悠闲的生活。
不过在1956年，他还是出来加入了民革，参加了工作，为社会主义的建设而建言献策。
